More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1548 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 405 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  63.05 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  62.07 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  57.83 
 
 		 409 aa  441  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 440 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  27.82 
 
 		 421 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 		 440 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  29.64 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.83 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  27.41 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.52 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.43 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 392 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.61 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.75 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.07 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.71 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1695  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.21 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  25.28 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  27.25 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 395 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.5 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  23.25 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  26.46 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  28.78 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  26.74 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  26.36 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>