More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7952 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
384 aa  771    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 
373 aa  155  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.51 
 
 
397 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
397 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
397 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
397 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4482  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
371 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.98 
 
 
396 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.9 
 
 
399 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
397 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.39 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
383 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
378 aa  126  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
399 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
398 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
372 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 
382 aa  122  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 
404 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
404 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
386 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
404 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  31.14 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.78 
 
 
378 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
384 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 
386 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
382 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 
390 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 
377 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
396 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
393 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 
405 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  32.75 
 
 
382 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
400 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
376 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  26.38 
 
 
383 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
376 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  26.75 
 
 
379 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
377 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
409 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
374 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
373 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
381 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
379 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 
394 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
379 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
379 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
379 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.46 
 
 
382 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 
382 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 
397 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.39 
 
 
376 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.97 
 
 
385 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 
386 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
386 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
382 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.07 
 
 
380 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
384 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  27.69 
 
 
379 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
382 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 
370 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  27.69 
 
 
379 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
379 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  27.69 
 
 
379 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
373 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  27.9 
 
 
389 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
379 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
389 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
379 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
381 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  27.38 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.57 
 
 
375 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  27.38 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
373 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
399 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.38 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.38 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.02 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2361  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00517611  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>