More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0592 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  91.67 
 
 
450 aa  729    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
447 aa  897    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  71.71 
 
 
449 aa  632  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  71.95 
 
 
451 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  51.04 
 
 
426 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  48.07 
 
 
435 aa  378  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  50.52 
 
 
416 aa  376  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  50.65 
 
 
433 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  37.73 
 
 
425 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 
427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
482 aa  200  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
392 aa  183  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
397 aa  159  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
409 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
824 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  25.45 
 
 
826 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
399 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
752 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0585  Extracellular ligand-binding receptor  25.11 
 
 
453 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 
440 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
376 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
369 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 
396 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
377 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
433 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
370 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
373 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  27.22 
 
 
421 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
370 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
376 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 
386 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
412 aa  96.7  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
440 aa  96.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.14 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.03 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.18 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  28.18 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  28.18 
 
 
372 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.18 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.18 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.18 
 
 
380 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 
371 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
401 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
404 aa  93.6  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
371 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
415 aa  93.2  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
373 aa  93.2  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.94 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
399 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.65 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
383 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.65 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.65 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.65 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
413 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
382 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.58 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.58 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.55 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.43 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  25.43 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.11 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.43 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.48 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
386 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.65 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.48 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.48 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
400 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.36 
 
 
378 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
401 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
397 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
377 aa  90.5  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
386 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
380 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
419 aa  90.1  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
380 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
375 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  27.2 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>