206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0556 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  100 
 
 		 826 aa  1637    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 		 392 aa  152  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 		 392 aa  151  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 		 425 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  55.49 
 
 		 2313 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 752 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 		 447 aa  104  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 824 aa  103  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 397 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  40.52 
 
 		 926 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 409 aa  98.6  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  43.7 
 
 		 489 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 449 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  31.78 
 
 		 630 aa  89.7  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 416 aa  88.2  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  42.06 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.01 
 
 		 830 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  71.43 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1977 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.29 
 
 		 671 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 435 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  67.36 
 
 		 848 aa  71.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  45.34 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  47.17 
 
 		 625 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1022 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  39.29 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  43.71 
 
 		 2353 aa  68.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  43.68 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34 
 
 		 853 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 482 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  34.67 
 
 		 453 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 377 aa  67.4  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  39.18 
 
 		 3471 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  39.18 
 
 		 3472 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  42.13 
 
 		 3521 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  34.35 
 
 		 1053 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  28.97 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  38.19 
 
 		 2449 aa  63.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  35.92 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 885 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1197 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.72 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 475 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 707 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 1188 aa  61.6  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1234 aa  61.6  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  34.26 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1236 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1236 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1236 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  36.54 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 547 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  42.14 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  29.63 
 
 		 916 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0538  histidine kinase  25.48 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1238 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1238 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1238 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  35.78 
 
 		 1236 aa  58.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1238 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  25.52 
 
 		 993 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  42.86 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  36.7 
 
 		 1200 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1245 aa  58.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  35.48 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 869 aa  58.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  25 
 
 		 1003 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 403 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  40.54 
 
 		 522 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 896 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  33.33 
 
 		 727 aa  56.6  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.07 
 
 		 257 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  25.2 
 
 		 267 aa  57  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 581 aa  56.6  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 651 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>