25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2252 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1022 aa  2058    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  33.54 
 
 		 1065 aa  84  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16331  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  82.8  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.377957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0783  hypothetical protein  37.93 
 
 		 166 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.024345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2253  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0483371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  39.77 
 
 		 570 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 566 aa  54.7  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 505 aa  53.5  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 		 734 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01443  hypothetical protein  38.28 
 
 		 1309 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.968118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2611  hypothetical protein  29.61 
 
 		 739 aa  48.5  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 750 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.81 
 
 		 739 aa  48.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 		 1694 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.17 
 
 		 810 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  29.26 
 
 		 635 aa  47.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 3301 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 616 aa  45.8  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.14 
 
 		 622 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 878 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.35 
 
 		 632 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.89 
 
 		 725 aa  45.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  42.86 
 
 		 1661 aa  45.4  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 486 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>