More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3235 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
734 aa  1501    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 
1074 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  45.95 
 
 
442 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  47.2 
 
 
878 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2721  hypothetical protein  31.21 
 
 
378 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.18 
 
 
810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2581  hypothetical protein  30.82 
 
 
517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.81 
 
 
632 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.4 
 
 
725 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
1737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1210  hypothetical protein  30.51 
 
 
372 aa  110  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.865391  normal  0.0104446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  36.2 
 
 
676 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  36.65 
 
 
486 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  43.04 
 
 
685 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  40.8 
 
 
955 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  36.42 
 
 
887 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
1061 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
3145 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  38.04 
 
 
1213 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
3172 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 
637 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  39.61 
 
 
816 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.65 
 
 
875 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
750 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
681 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
448 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.16 
 
 
622 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
847 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
311 aa  95.1  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
750 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
754 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  35.95 
 
 
832 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1487  hypothetical protein  31.94 
 
 
612 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  34.88 
 
 
682 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
3301 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
739 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
718 aa  91.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.93 
 
 
764 aa  91.3  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
909 aa  90.9  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 
583 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
573 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
1486 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
818 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
217 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
784 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
754 aa  87.4  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
612 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  36.71 
 
 
865 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.78 
 
 
681 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1488  hypothetical protein  40.19 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  30.54 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
824 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.1 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 
988 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 
1600 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.97 
 
 
1022 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.06 
 
 
577 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  34.42 
 
 
733 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
789 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0023  tetratricopeptide TPR_2  55.07 
 
 
193 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.48 
 
 
1676 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.76 
 
 
594 aa  81.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 
1154 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 
1056 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
374 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.81 
 
 
603 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  42.57 
 
 
2059 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 
1056 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  31.85 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
927 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.03 
 
 
340 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 
274 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  35.06 
 
 
780 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
706 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
715 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  32.94 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
602 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.07 
 
 
503 aa  77.4  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
828 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
274 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
828 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.3 
 
 
373 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 
274 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  34.64 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.12 
 
 
1694 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.51 
 
 
626 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.25 
 
 
587 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
1276 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
808 aa  75.1  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
594 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
1252 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1481  sulfotransferase  30.89 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
1252 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  37.5 
 
 
545 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>