39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2043 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 415 aa  859    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 		 824 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 451 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  23.8 
 
 		 826 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  23.59 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  22.82 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  26.77 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  22.75 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.29 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0042  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  22.53 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  22.77 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  22.52 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  21.2 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.69 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>