More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0716 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
824 aa  1662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
752 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  32.6 
 
 
425 aa  177  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
482 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
427 aa  156  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
392 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
447 aa  152  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
451 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
463 aa  148  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 
450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
409 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 
449 aa  128  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
415 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  27.1 
 
 
826 aa  117  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
435 aa  100  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 
416 aa  99.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
397 aa  98.6  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
433 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
426 aa  95.9  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  29.17 
 
 
421 aa  77  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
373 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.36 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
388 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
375 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  24.88 
 
 
422 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
391 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
401 aa  67.4  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
391 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.89 
 
 
393 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
409 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
380 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
377 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  26.02 
 
 
368 aa  65.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 
373 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
449 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.02 
 
 
368 aa  65.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 
441 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
380 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
367 aa  64.7  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
440 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
440 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 
405 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 
405 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1054  extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 
370 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
377 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.3 
 
 
371 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
393 aa  63.9  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.07 
 
 
380 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 
375 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.3 
 
 
371 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  26.78 
 
 
414 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
366 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.98 
 
 
432 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
412 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
424 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
367 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
375 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1184  Extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 
370 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.36 
 
 
392 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
366 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
376 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25 
 
 
376 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
376 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
380 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  27.98 
 
 
405 aa  62  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
380 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
399 aa  62  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.98 
 
 
405 aa  62  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.85 
 
 
446 aa  62.4  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
380 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
394 aa  62.4  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 
367 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  26.47 
 
 
395 aa  62  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  23.65 
 
 
393 aa  61.6  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
368 aa  61.6  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
380 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
380 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  25 
 
 
380 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
373 aa  61.6  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
375 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  30.65 
 
 
368 aa  61.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
399 aa  61.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
384 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
384 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
372 aa  61.2  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 
371 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
373 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
366 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
369 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
366 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
373 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 
373 aa  60.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
375 aa  60.1  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>