More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0504 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  88.11 
 
 
433 aa  717    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  83.86 
 
 
435 aa  717    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
416 aa  845    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  85.9 
 
 
426 aa  713    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  50.52 
 
 
447 aa  375  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  49.61 
 
 
451 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  48.45 
 
 
450 aa  360  3e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  44.37 
 
 
449 aa  349  5e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
427 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
482 aa  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  32.64 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 
392 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 
392 aa  139  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
409 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  25.93 
 
 
826 aa  96.3  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
752 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 
824 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  25.88 
 
 
372 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.88 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.88 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  25.88 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.88 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.88 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
404 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.88 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.82 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  25.97 
 
 
380 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.76 
 
 
404 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  25.62 
 
 
377 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.67 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.47 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  25.47 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.73 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.08 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6859  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278676  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.13 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.25 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.36 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.99 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.66 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.67 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>