269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2456 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
409 aa  842    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
450 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 
447 aa  156  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
425 aa  150  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 
427 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 
449 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
482 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
392 aa  133  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
824 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
426 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 
415 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
435 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  32.25 
 
 
752 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
392 aa  123  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  25.63 
 
 
826 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
397 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.97 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  27.46 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  26.85 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.63 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
440 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.56 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
367 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  23.26 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  22.92 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  28.8 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
440 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  22.92 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
440 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 
424 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  26.51 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 
449 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0487  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.168849  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.32 
 
 
677 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.13 
 
 
384 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
383 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
376 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  21.75 
 
 
380 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
394 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.32 
 
 
376 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0620  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
388 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  22.28 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.36 
 
 
404 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  22.34 
 
 
393 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  26.13 
 
 
741 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  21.75 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>