177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2659 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 752 aa  1535    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 824 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 482 aa  126  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 409 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 392 aa  117  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  30.03 
 
 		 826 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 450 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 		 447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 		 392 aa  110  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 449 aa  109  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 415 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 427 aa  98.6  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 		 426 aa  95.5  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 		 416 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 		 433 aa  90.9  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 397 aa  89.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  22.9 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.46 
 
 		 425 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 392 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  35.64 
 
 		 372 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15940  Extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.56 
 
 		 677 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 		 379 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  26.19 
 
 		 368 aa  55.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.19 
 
 		 368 aa  55.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  25.71 
 
 		 415 aa  55.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2032  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 418 aa  55.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 795 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 795 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 375 aa  54.7  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 377 aa  54.3  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 441 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.72 
 
 		 382 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 		 426 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 440 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  33.93 
 
 		 379 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  35.63 
 
 		 400 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 385 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 368 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.35 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 392 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.23 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 		 412 aa  52.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.54 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.63 
 
 		 393 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  27.32 
 
 		 421 aa  52  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 		 370 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 381 aa  52  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4926  Extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 396 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  23.83 
 
 		 414 aa  52  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 380 aa  51.6  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  21.94 
 
 		 377 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 380 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 406 aa  51.6  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 		 377 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  21.84 
 
 		 378 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 375 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 380 aa  50.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 		 440 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  39.39 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 372 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 		 440 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.39 
 
 		 394 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 		 389 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 381 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 372 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 		 387 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 445 aa  49.3  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 373 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 376 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0585  Extracellular ligand-binding receptor  27.31 
 
 		 453 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 416 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 410 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 393 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 758 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 		 471 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 409 aa  48.5  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 399 aa  48.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  23.83 
 
 		 383 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 397 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 379 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 		 390 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>