More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1381 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1381  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 452 aa  936    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  76.21 
 
 		 451 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  73.23 
 
 		 448 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3135  twin-arginine translocation pathway signal  66.52 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0672684  normal  0.543619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3830  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  65.58 
 
 		 450 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1944  twin-arginine translocation pathway signal  66.06 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2759  twin-arginine translocation pathway signal  66.14 
 
 		 450 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3718  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  64.94 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2811  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  35.71 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1752  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein  32.49 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  31.31 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1749  ABC transporter substrate-binding protein  29.04 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239653  normal  0.31899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.28 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1758  leucine-binding protein  29.02 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0284515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1283  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.74 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.71 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  30.59 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2318  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  25.63 
 
 		 403 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  26.39 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8044  Extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 406 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 402 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.42 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0619  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.42 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3485  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0659  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.42 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  26.12 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2466  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469696  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3212  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.4 
 
 		 396 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.978444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4077  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5573  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.09 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.69 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3120  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  25.19 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.19 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  26.92 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.35 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  26.82 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3615  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  27.46 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.489489  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  25.63 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  27.59 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  25.89 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.63 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0008  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0939525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  29.43 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1421  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  28.96 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  26.61 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  25.26 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1077  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000554995  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  24.77 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  26.41 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0076  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  24.77 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0087  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  26.55 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3503  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.22 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  26.92 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  27.01 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.18 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 		 417 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2079  branched chain amino acid transport system substrate binding protein  26.27 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0048  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  25.71 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.71 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3756  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  23.32 
 
 		 407 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.48 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  28.07 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 401 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  29.21 
 
 		 411 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>