More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3212 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3212  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
396 aa  815    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.978444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  67.57 
 
 
400 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0619  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  67.3 
 
 
400 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0659  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  67.3 
 
 
400 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0430109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3458  Extracellular ligand-binding receptor  62.95 
 
 
401 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  59.64 
 
 
399 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  59.64 
 
 
399 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  60.7 
 
 
392 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.58 
 
 
401 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  62.67 
 
 
402 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.95 
 
 
397 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.84 
 
 
401 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1581  Extracellular ligand-binding receptor  62.12 
 
 
401 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  61 
 
 
407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  61 
 
 
407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  61 
 
 
402 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0757  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.95 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4272  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  58.66 
 
 
403 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844691  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7652  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.12 
 
 
289 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  27.47 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2811  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 
450 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.49 
 
 
415 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2466  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
400 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469696  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3120  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  28.46 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347887  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
384 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1752  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein  26.26 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225612  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.2 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
404 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  29.07 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
415 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1944  twin-arginine translocation pathway signal  28.94 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4077  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.15 
 
 
402 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 
397 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
397 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
415 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3047  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
408 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1381  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 
452 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0076  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
399 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
413 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1077  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 
397 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000554995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
417 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
402 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2759  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 
450 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
415 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
415 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.18 
 
 
402 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 
398 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3830  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.01 
 
 
450 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  26.36 
 
 
451 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
411 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 
402 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5573  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.7 
 
 
396 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0087  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
399 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356646  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3135  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 
450 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0672684  normal  0.543619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3718  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  26.77 
 
 
450 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 
402 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
398 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
410 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  25.69 
 
 
398 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.13 
 
 
399 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56224  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0198  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  25.94 
 
 
398 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3991  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.94 
 
 
398 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4065  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.94 
 
 
398 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3267  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.54 
 
 
399 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1607  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.33 
 
 
392 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.4 
 
 
402 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2936  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.53 
 
 
398 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0103  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.27 
 
 
399 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32797  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
432 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3375  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.53 
 
 
398 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2970  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.42 
 
 
399 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.42 
 
 
399 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
406 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1283  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.46 
 
 
401 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154147  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 
448 aa  99.8  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2318  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  25.73 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8044  Extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5162  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.99 
 
 
398 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15516  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  25.88 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
417 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  27.32 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  25.27 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  24.87 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  24.23 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0357  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
408 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  23.77 
 
 
405 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  26.79 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2460  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  24.68 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.04538  normal  0.187515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.95 
 
 
400 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>