More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0103 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3047  extracellular ligand-binding receptor  83.42 
 
 
404 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2936  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  92.73 
 
 
398 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0198  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  92.48 
 
 
398 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  97.74 
 
 
399 aa  772    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56224  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3267  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  97.74 
 
 
399 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  92.23 
 
 
398 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3375  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  92.73 
 
 
398 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0087  extracellular ligand-binding receptor  95.24 
 
 
399 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  86.87 
 
 
404 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4065  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  92.48 
 
 
398 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  86.11 
 
 
404 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2970  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  99.75 
 
 
399 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0076  extracellular ligand-binding receptor  95.49 
 
 
399 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  99.75 
 
 
399 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3991  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  92.48 
 
 
398 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0103  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
399 aa  815    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32797  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1607  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  93.28 
 
 
392 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  76.08 
 
 
402 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  75.06 
 
 
402 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  75.06 
 
 
402 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  73.82 
 
 
402 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  73.13 
 
 
402 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3120  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  69.52 
 
 
400 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2466  Extracellular ligand-binding receptor  69.52 
 
 
400 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3756  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  69.55 
 
 
407 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4077  extracellular ligand-binding receptor  67.92 
 
 
397 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1077  extracellular ligand-binding receptor  70.62 
 
 
397 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000554995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  66.58 
 
 
398 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  66.24 
 
 
404 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  66.08 
 
 
398 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  69.81 
 
 
397 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  66.67 
 
 
406 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5162  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  65.66 
 
 
398 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15516  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0008  extracellular ligand-binding receptor  66.22 
 
 
400 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0939525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1283  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  66.85 
 
 
401 aa  528  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154147  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2318  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  64.88 
 
 
403 aa  524  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3485  Extracellular ligand-binding receptor  63.32 
 
 
398 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8044  Extracellular ligand-binding receptor  60.37 
 
 
406 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5573  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.58 
 
 
396 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  58.78 
 
 
412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  58.51 
 
 
413 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0514  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.95 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  55.77 
 
 
419 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  56.78 
 
 
397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  54.36 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  55.31 
 
 
404 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  57.87 
 
 
403 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  55.19 
 
 
395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  55.95 
 
 
399 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  53.96 
 
 
409 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  56.65 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  53.99 
 
 
409 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  55.58 
 
 
401 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  55.05 
 
 
397 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  56.03 
 
 
404 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0275  putative ureA/short-chain amide ABC transporter  54.96 
 
 
401 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  56.3 
 
 
404 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  53.62 
 
 
401 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3849  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  56.14 
 
 
392 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375619  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  53.12 
 
 
401 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  55.41 
 
 
406 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  52.39 
 
 
409 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  55.95 
 
 
401 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0486  substrate-binding protein  55.76 
 
 
401 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7539  putative ABC transporter (substrate binding protein)  56.38 
 
 
394 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  54.45 
 
 
417 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  54.69 
 
 
400 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  53.09 
 
 
408 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  55.76 
 
 
400 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.89 
 
 
401 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  54.42 
 
 
404 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  53.91 
 
 
401 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3891  extracellular ligand-binding receptor  50.5 
 
 
406 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  53.62 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0554  ureA/short-chain amide ABC transporter  55.08 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.930825  normal  0.0786148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  52.28 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  55.5 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  53.85 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  52.21 
 
 
415 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  52.76 
 
 
427 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  49.12 
 
 
405 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  52.37 
 
 
400 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  52.37 
 
 
399 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  50.27 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  51.22 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  50.4 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  52.58 
 
 
403 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.76 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  51.96 
 
 
409 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  53.33 
 
 
406 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  52.84 
 
 
402 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  49.27 
 
 
420 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  52.65 
 
 
409 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  51.14 
 
 
405 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  50.27 
 
 
419 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  51.21 
 
 
413 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  52.53 
 
 
403 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.75 
 
 
401 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  45.39 
 
 
411 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6351  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  50.4 
 
 
403 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>