More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2530 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1190  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  88.56 
 
 
401 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
402 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  57.52 
 
 
419 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  59.35 
 
 
405 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  53.46 
 
 
420 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  54.47 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  51.81 
 
 
417 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  52.12 
 
 
401 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.12 
 
 
401 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  52.41 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  51.59 
 
 
401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  52.38 
 
 
401 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  52.38 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  50.13 
 
 
406 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  49.38 
 
 
409 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  50.26 
 
 
401 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  51.6 
 
 
400 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  50.93 
 
 
400 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  50.4 
 
 
400 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  50.4 
 
 
400 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  49.59 
 
 
412 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50 
 
 
403 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  49.46 
 
 
413 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  50.51 
 
 
400 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  51.06 
 
 
403 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  49.61 
 
 
399 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  50.38 
 
 
411 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  48.11 
 
 
403 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.23 
 
 
401 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  50.27 
 
 
400 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  50.63 
 
 
404 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6351  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  49.6 
 
 
403 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1473  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  48.54 
 
 
406 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267716  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  49.35 
 
 
404 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1850  putative ABC transporter, substrate binding protein  47.88 
 
 
402 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3877  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  48.54 
 
 
406 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  47.7 
 
 
405 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  48.18 
 
 
395 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  51.32 
 
 
411 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  47.97 
 
 
419 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  46.17 
 
 
409 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  49.07 
 
 
402 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  47.45 
 
 
409 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  45.18 
 
 
405 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  50.64 
 
 
409 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  52.7 
 
 
406 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  46.52 
 
 
404 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  49.45 
 
 
405 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  48.21 
 
 
402 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  48.36 
 
 
405 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  50.39 
 
 
412 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  47.68 
 
 
404 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  46.75 
 
 
409 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  48.42 
 
 
405 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  49.75 
 
 
401 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  50.27 
 
 
404 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  46.7 
 
 
403 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  48.1 
 
 
403 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  48.33 
 
 
399 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  47.27 
 
 
397 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  47.57 
 
 
397 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  47.45 
 
 
408 aa  358  9e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  47.62 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2460  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.63 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.04538  normal  0.187515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  48.11 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  48.41 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.43 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6432  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00470186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  47.74 
 
 
402 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3849  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  48.4 
 
 
392 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375619  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  48.65 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  48.94 
 
 
404 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  48.67 
 
 
404 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  43.81 
 
 
409 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3282  Extracellular ligand-binding receptor  49.19 
 
 
408 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2079  branched chain amino acid transport system substrate binding protein  47.21 
 
 
404 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3615  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.95 
 
 
404 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.489489  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  46.67 
 
 
404 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1421  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  47.41 
 
 
403 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3891  extracellular ligand-binding receptor  46.45 
 
 
406 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  49.73 
 
 
412 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3503  putative ABC transporter, substrate binding protein  46.44 
 
 
408 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  44.5 
 
 
413 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  44.86 
 
 
402 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0969  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  47.81 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0731  hypothetical protein  48 
 
 
405 aa  342  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183807  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2953  ABC transporter substrate-binding protein  47.12 
 
 
408 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2999  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  45.79 
 
 
408 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0873398  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  49.59 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  45.29 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.17 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.47 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  44.02 
 
 
402 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3520  extracellular ligand-binding receptor  47.97 
 
 
407 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363976  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
401 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3783  ABC transporter substrate-binding protein  45.41 
 
 
405 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  44.11 
 
 
402 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.11 
 
 
402 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4449  Extracellular ligand-binding receptor  47.15 
 
 
416 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3756  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  44.12 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.260098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>