245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1758 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1758  leucine-binding protein  100 
 
 
425 aa  855    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0284515  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1749  ABC transporter substrate-binding protein  60.09 
 
 
442 aa  501  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239653  normal  0.31899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1944  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2759  twin-arginine translocation pathway signal  28.05 
 
 
450 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3830  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.79 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3135  twin-arginine translocation pathway signal  28.05 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0672684  normal  0.543619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  29.27 
 
 
451 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3718  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.27 
 
 
450 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  28.92 
 
 
448 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1381  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
415 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  25.82 
 
 
451 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1752  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein  27.73 
 
 
438 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
416 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2811  twin-arginine translocation pathway signal  24.49 
 
 
450 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469763  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  22.55 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  21.54 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  21.28 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.43 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1214  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  21.28 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.44 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  22.42 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1581  Extracellular ligand-binding receptor  22.34 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  22.16 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
407 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  25.21 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  21.66 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3458  Extracellular ligand-binding receptor  21.86 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  21.95 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  20.56 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  20.56 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3212  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.84 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.978444  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  23.4 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  21.07 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
408 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 
383 aa  63.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0757  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.41 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  23.41 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  21.91 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  21.91 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4272  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.91 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.75 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0048  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  22.08 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  20.81 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  20.81 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2318  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  22.22 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  22.72 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0659  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  22.5 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0430109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0619  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.5 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.32 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  21.14 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  23.1 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
406 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  22.94 
 
 
402 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3120  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  23.45 
 
 
400 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347887  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  24.59 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2466  Extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  23.06 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  22.25 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  22.39 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  20.98 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  23.84 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3485  Extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8044  Extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  24.31 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  23.19 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  23.19 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  20.25 
 
 
419 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3572  ABC transporter substrate-binding protein  23.45 
 
 
422 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536665  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.51 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
415 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.46 
 
 
419 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0498  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.1 
 
 
416 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1372  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
395 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3381  ABC transporter substrate-binding protein  22.69 
 
 
417 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3690  urea ABC transporter, urea binding protein  22.69 
 
 
417 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  21.43 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0103  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.99 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32797  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.26 
 
 
419 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  21.8 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  21.37 
 
 
413 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  22.48 
 
 
390 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.57 
 
 
419 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.81 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782241  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.5 
 
 
419 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  22.5 
 
 
421 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>