More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2293 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  98.57 
 
 		 419 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  81.93 
 
 		 425 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  91.65 
 
 		 419 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  81.93 
 
 		 404 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  81.77 
 
 		 468 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  94.75 
 
 		 419 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  81.93 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  95.94 
 
 		 419 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  79.85 
 
 		 426 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  77.97 
 
 		 423 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  81.93 
 
 		 425 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  81.44 
 
 		 425 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  81.93 
 
 		 425 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  95.47 
 
 		 441 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 419 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  95.47 
 
 		 419 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  81.93 
 
 		 425 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  65.39 
 
 		 417 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  63.22 
 
 		 416 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  63.95 
 
 		 418 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  62.98 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  62.74 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  58.9 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  60.48 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  58.41 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  60.24 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  58.41 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  61.13 
 
 		 426 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  61.81 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  60.51 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  59.3 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  43.58 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  41.56 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  41.56 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  40.25 
 
 		 416 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  40.75 
 
 		 416 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 411 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  42.32 
 
 		 412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  41.23 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  41.63 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  41.93 
 
 		 411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  40.52 
 
 		 412 aa  312  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.63 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  40.82 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  41.69 
 
 		 411 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  41.06 
 
 		 409 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  42.36 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  42.43 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  42.31 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  41.09 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  42.21 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.09 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  42.13 
 
 		 411 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  40.95 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  43.26 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  43.65 
 
 		 412 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  41.11 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  38.37 
 
 		 422 aa  292  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  44.69 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  38.5 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  34.89 
 
 		 415 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.59 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.35 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 408 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 411 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.65 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  25.39 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.39 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.55 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  25.84 
 
 		 395 aa  90.5  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  23.92 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.34 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.92 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  26.47 
 
 		 451 aa  86.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  27.74 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.8 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  25.47 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  27.86 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>