More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1399 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  78.9 
 
 
417 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  76.59 
 
 
418 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
416 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  80.58 
 
 
418 aa  692    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  80.58 
 
 
418 aa  692    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  76.59 
 
 
418 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  90.36 
 
 
416 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  62.2 
 
 
411 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  61.95 
 
 
411 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  60.72 
 
 
412 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  57.6 
 
 
411 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  57.38 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  59.81 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  58.6 
 
 
411 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  58.48 
 
 
411 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  57.7 
 
 
409 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  55.77 
 
 
411 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  56.02 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  53.4 
 
 
411 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  55.38 
 
 
410 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  63.35 
 
 
322 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  49.64 
 
 
409 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  50.12 
 
 
410 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  49.16 
 
 
409 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 
410 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  42.86 
 
 
417 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  50.76 
 
 
412 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  51.53 
 
 
411 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  43.37 
 
 
468 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  41.06 
 
 
436 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  42.52 
 
 
421 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  40.05 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  41.26 
 
 
434 aa  332  9e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  41.9 
 
 
421 aa  332  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  43.88 
 
 
422 aa  328  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  41.75 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  45.5 
 
 
420 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  40.86 
 
 
437 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  43.77 
 
 
427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  40.86 
 
 
433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  42.82 
 
 
419 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  40.66 
 
 
426 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.32 
 
 
423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.25 
 
 
419 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.25 
 
 
419 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  40.8 
 
 
425 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  40.8 
 
 
404 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  40.8 
 
 
425 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  40.45 
 
 
426 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  40.8 
 
 
425 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  39.24 
 
 
451 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  42.2 
 
 
419 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  40.8 
 
 
425 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  40.48 
 
 
426 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40 
 
 
441 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40 
 
 
419 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  40.8 
 
 
425 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.75 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.75 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.85 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  40.8 
 
 
425 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 
430 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  38.82 
 
 
425 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  33.65 
 
 
415 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.57 
 
 
471 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.57 
 
 
471 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
408 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
415 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
415 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
371 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  28.84 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
415 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 
407 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  28.84 
 
 
407 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  26.16 
 
 
395 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.79 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.25 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.03 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.03 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.03 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.52 
 
 
371 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
398 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.01 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.9 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.62 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>