More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2015 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  78.45 
 
 		 419 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.01 
 
 		 419 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  77.97 
 
 		 419 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  88.16 
 
 		 468 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.27 
 
 		 441 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  77.97 
 
 		 419 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.27 
 
 		 419 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 423 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  76.37 
 
 		 426 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  77.53 
 
 		 404 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  78.73 
 
 		 419 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  77.53 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  77.53 
 
 		 425 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  77.53 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  77.53 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  77.02 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  77.53 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  65.65 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  65.04 
 
 		 416 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  62.05 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  62.32 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  61.14 
 
 		 419 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  61.37 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  62.75 
 
 		 436 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  61.42 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  60.2 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  57.62 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  61.42 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  60.76 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  57.52 
 
 		 426 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  60.1 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  41.32 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  41.32 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  42.09 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  42.09 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  41.84 
 
 		 418 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  41.84 
 
 		 418 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  42.86 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  41.12 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  42 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  41.98 
 
 		 427 aa  302  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  39.57 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  39.57 
 
 		 411 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  42.03 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  39.43 
 
 		 411 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.73 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  40.33 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  41.48 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  39.43 
 
 		 411 aa  294  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  38.9 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.57 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  39.29 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  40.36 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  40.2 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  39.85 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  41.16 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.98 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  40.76 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  39.67 
 
 		 411 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  42.13 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  37.81 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  44.06 
 
 		 322 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  37.94 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  34.7 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.68 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.44 
 
 		 471 aa  183  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  24.45 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  25.8 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  24.88 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  24.63 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.14 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  25.99 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.99 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  25.73 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4077  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  24.57 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.74 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>