More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1679 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  82.48 
 
 		 411 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  80.54 
 
 		 411 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  80.05 
 
 		 411 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 411 aa  858    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  78.83 
 
 		 412 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  99.51 
 
 		 411 aa  855    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  77.56 
 
 		 409 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  79.85 
 
 		 412 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  92.86 
 
 		 322 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  67.49 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  64.96 
 
 		 411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  65.45 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  62.38 
 
 		 411 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  63.5 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  62.2 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  62.47 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  61.31 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  62.47 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  59.75 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  59.75 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  60.67 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  48.18 
 
 		 410 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  49.22 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  50.51 
 
 		 412 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  49.03 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  47.83 
 
 		 409 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  48.01 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  42.96 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  42.13 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  41.29 
 
 		 416 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  41.96 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  40.75 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  40.15 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  40.76 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  40.76 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.69 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  41.94 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  41.31 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.69 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.96 
 
 		 419 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.46 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  40.1 
 
 		 426 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  42.39 
 
 		 421 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.46 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.29 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  40.94 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  39.57 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.2 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  40.65 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  40.65 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  40.65 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  40.65 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.43 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  40.65 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  39.65 
 
 		 451 aa  285  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  39.56 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  40.65 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  38.66 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  38.39 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  40.65 
 
 		 425 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  38.92 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  39.19 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  37.28 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.24 
 
 		 471 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  31.7 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.24 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2945  extracellular ligand-binding receptor  84.29 
 
 		 81 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.67 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.06 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  25.06 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  25.06 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 375 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3458  Extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.57 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 		 411 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.07 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.39 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.12 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  23.34 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.44 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.44 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.44 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>