More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0024 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  100 
 
 
471 aa  968    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  99.58 
 
 
471 aa  964    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  65.93 
 
 
415 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  33.58 
 
 
434 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  33.25 
 
 
426 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  32.06 
 
 
421 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.09 
 
 
419 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  33.66 
 
 
427 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  32.92 
 
 
451 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  32.51 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.85 
 
 
419 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  32.01 
 
 
468 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.1 
 
 
419 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 
422 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
430 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  33.02 
 
 
419 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.61 
 
 
419 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.64 
 
 
441 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.37 
 
 
419 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 
420 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  32.39 
 
 
419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  29.58 
 
 
416 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  31.27 
 
 
433 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  31.27 
 
 
437 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  33.74 
 
 
411 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.85 
 
 
419 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  32.25 
 
 
421 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  32.86 
 
 
411 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  32.5 
 
 
417 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.94 
 
 
423 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  28.64 
 
 
417 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  31.67 
 
 
418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  32.7 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
418 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  31.64 
 
 
425 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.64 
 
 
425 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  31.64 
 
 
425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  31.58 
 
 
418 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  31.64 
 
 
425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  31.64 
 
 
425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  31.64 
 
 
404 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  31.92 
 
 
426 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 
409 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
416 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 
412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  31.4 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
411 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  29.68 
 
 
415 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
411 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  31.57 
 
 
412 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
418 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
418 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 
411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  33.17 
 
 
410 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  33.08 
 
 
412 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  32.86 
 
 
409 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  33.66 
 
 
409 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 
411 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  29.38 
 
 
426 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 
410 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 
410 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  28.54 
 
 
425 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
322 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  33.98 
 
 
411 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
396 aa  107  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
396 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  25.91 
 
 
422 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 
384 aa  84  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  22.68 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  27.32 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  21.76 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  27.32 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.97 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  26.88 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  27.14 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3212  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.37 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.978444  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  23.92 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3766  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  26.88 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  26.88 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  26.88 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  26.88 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.03 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  26.03 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>