More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1836 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  100 
 
 		 404 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  99.75 
 
 		 425 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.43 
 
 		 419 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  99.75 
 
 		 425 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.68 
 
 		 419 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  100 
 
 		 425 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  92.14 
 
 		 426 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.68 
 
 		 419 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.55 
 
 		 419 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  99.26 
 
 		 425 aa  800    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  100 
 
 		 425 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.18 
 
 		 441 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  100 
 
 		 425 aa  810    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  77.78 
 
 		 468 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.93 
 
 		 419 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.18 
 
 		 419 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  77.53 
 
 		 423 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  65.1 
 
 		 416 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  64.63 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  64.29 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  62.75 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  63.5 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  56.76 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  62.56 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  59.9 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  59.49 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  58.25 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  59.39 
 
 		 433 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  59.34 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  59.39 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  56.78 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  42.29 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  42.29 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  40.8 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  40.8 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  42.89 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  41.37 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  41.37 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  40.9 
 
 		 415 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  41.75 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  40.65 
 
 		 411 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  40.65 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  40.55 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  40.65 
 
 		 409 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  40.65 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  41.65 
 
 		 427 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  41.37 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  38.9 
 
 		 412 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  39.05 
 
 		 411 aa  302  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.99 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  41.5 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  40.99 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  40.45 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.69 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  40.2 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.69 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  37.35 
 
 		 422 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  42.24 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  39.2 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.88 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  44.04 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  34.29 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.37 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.13 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  26.86 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  26.6 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 411 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.57 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  25.96 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.21 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.78 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  25.14 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.07 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.65 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1352  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>