More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1283 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  99.29 
 
 		 425 aa  840    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  99.26 
 
 		 404 aa  800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  77.27 
 
 		 468 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  99.06 
 
 		 425 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.1 
 
 		 419 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.33 
 
 		 419 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  99.29 
 
 		 425 aa  840    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  99.06 
 
 		 425 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  90.85 
 
 		 426 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  80.05 
 
 		 419 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  99.29 
 
 		 425 aa  840    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.33 
 
 		 419 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.81 
 
 		 441 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.81 
 
 		 419 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  100 
 
 		 425 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.81 
 
 		 419 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  73.71 
 
 		 423 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  64.63 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  65.1 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  64.8 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  63.25 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  62.53 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  56.76 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  59.9 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  62.56 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  57.87 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  59.49 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  58.47 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  57.86 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  59.39 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  55.34 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  42.29 
 
 		 418 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  42.29 
 
 		 418 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  40.58 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  40.63 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  42.89 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  41.37 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  41.37 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  41.81 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  40.9 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  40.24 
 
 		 409 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 		 411 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  40.33 
 
 		 411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  41.65 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.2 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  41.71 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  38.04 
 
 		 412 aa  302  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  38.39 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  40.43 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  41.11 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.75 
 
 		 410 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.72 
 
 		 409 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  40.93 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  40.2 
 
 		 410 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  37.35 
 
 		 422 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.98 
 
 		 411 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  38.94 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  41.62 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  44.04 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  34.04 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.37 
 
 		 471 aa  190  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.13 
 
 		 471 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  26.77 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 397 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 		 407 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  26.51 
 
 		 407 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1376  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 415 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.416271  normal  0.0984666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  26.29 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  26.9 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.57 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.21 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.78 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.8 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.6 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  26.64 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3830  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25.74 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  26.34 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>