278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2414 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 425 aa  875    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  73.03 
 
 		 430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  56.14 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  55.31 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  55.01 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  38.37 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  39.9 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  39.47 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  38.8 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  40.24 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  38.87 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  38.87 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  38.48 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  36.76 
 
 		 411 aa  283  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  38.11 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  39.95 
 
 		 412 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  39 
 
 		 416 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  37.34 
 
 		 418 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  37.34 
 
 		 418 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  37.6 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  37.17 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  36.15 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  37.68 
 
 		 411 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  36.38 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  38.04 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  39.65 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  39.71 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  37.94 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  38.44 
 
 		 468 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  37.97 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.92 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  37.71 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  39.85 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  35.31 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  37.03 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.1 
 
 		 419 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  39.18 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  38.62 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  36.62 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  36.62 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  36.39 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.5 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.1 
 
 		 419 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  37.35 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.25 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.25 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.25 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  38.9 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.94 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  39.36 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  38.7 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  36.98 
 
 		 426 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.5 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  34.42 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  40.55 
 
 		 322 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  37.84 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  37.84 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  31.48 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.47 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.47 
 
 		 471 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  25.07 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  24.93 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  25.29 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  24.59 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.38 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.38 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  24.38 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  24.44 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1352  extracellular ligand-binding receptor  37.14 
 
 		 432 aa  67  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  23.81 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1976  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  22.8 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.8 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  22.8 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  22.8 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  22.8 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  23.55 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>