More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2309 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2309  putative transporter signal peptide protein  100 
 
 		 433 aa  878    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2820  putative transporter signal peptide protein  99.77 
 
 		 437 aa  877    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.447107  normal  0.311269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3517  putative transporter signal peptide protein  75.7 
 
 		 426 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1487  putative transporter signal peptide protein  75.55 
 
 		 434 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.269633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2154  putative transporter signal peptide protein  80.96 
 
 		 451 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  73 
 
 		 421 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2382  putative transporter signal peptide protein  79.75 
 
 		 436 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1417  putative transporter signal peptide protein  70.21 
 
 		 421 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.752451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1494  putative transporter signal peptide protein  65.25 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1337  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  62.41 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491989  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  60.1 
 
 		 416 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  58.73 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62 
 
 		 419 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2070  transporter signal peptide protein  60.69 
 
 		 418 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  60.76 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2015  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.65 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195635  normal  0.277409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.28 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.28 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  60.24 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1898  transporter signal peptide protein  61.79 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  60.48 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2221  putative transporter signal peptide protein  60.73 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1022  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  60 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826628 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1836  amino acid-binding protein, putative  59.21 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1428  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  58.97 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1123  putative amino acid-binding protein  58.97 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1283  putative amino acid-binding protein  58.97 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  60.82 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0406  putative amino acid-binding protein  58.97 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0744  putative amino acid-binding protein  58.97 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1291  putative amino acid-binding protein  58.97 
 
 		 425 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  40.53 
 
 		 416 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  40.86 
 
 		 416 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  41.73 
 
 		 415 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  39.34 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  39.34 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 		 418 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 		 418 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  40.36 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.93 
 
 		 410 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0226  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  44.11 
 
 		 412 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2392  extracellular ligand-binding receptor  41.22 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0592634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  40.64 
 
 		 411 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  40.64 
 
 		 411 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  40.19 
 
 		 412 aa  302  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  40.64 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  40.33 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  39.24 
 
 		 409 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3169  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  43.22 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.268647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  40.33 
 
 		 409 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5870  Extracellular ligand-binding receptor  40.75 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  39.28 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  39.95 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  40.24 
 
 		 410 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  39.47 
 
 		 409 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2998  extracellular ligand-binding receptor  38.25 
 
 		 430 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  39.1 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1070  extracellular ligand-binding receptor  39.25 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4795  Extracellular ligand-binding receptor  38.38 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  43.69 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  39.71 
 
 		 411 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1685  extracellular ligand-binding receptor  37.87 
 
 		 422 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2414  extracellular ligand-binding receptor  36.93 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1573  branched-chain amino acid ABC transporter  34.52 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.93309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0024  branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.44 
 
 		 471 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0021  putative branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.19 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 408 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1440  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1826  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  22.79 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  23.15 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.21 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0008  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0939525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  24.4 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.94 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.19 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  24.18 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  23.78 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  23.78 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>