153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0152 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0152  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
432 aa  907    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2047  twin-arginine translocation pathway signal  58.94 
 
 
431 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1957  twin-arginine translocation pathway signal  62.63 
 
 
433 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3054  branched-chain amino acid ABC transporter  31.53 
 
 
426 aa  183  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.492113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 
592 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 
416 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.2 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  24.23 
 
 
389 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1908  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 
379 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  22.2 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.78 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  22.08 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  24.78 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.78 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  24.78 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  25.07 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
370 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 
390 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  25.07 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  25.07 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.99 
 
 
515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 
400 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  23.65 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 
461 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 
461 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  21.45 
 
 
424 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
474 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  33.64 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
419 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.75 
 
 
373 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
373 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  23.31 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.93 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.93 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0942  twin-arginine translocation pathway signal  34.17 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
395 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
372 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.1 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4564  extracellular ligand-binding receptor  23.15 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  22.94 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.73 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1580  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  22.66 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.2 
 
 
396 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
381 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
400 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 
379 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
409 aa  46.6  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  24.43 
 
 
662 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1045  twin-arginine translocation pathway signal  33.06 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  21.9 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  22.17 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3307  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0131361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4167  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  23.15 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
380 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>