More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0906 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
439 aa  887    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  43.25 
 
 
413 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
407 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 
432 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
411 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.92 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.92 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.27 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
397 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
408 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.84 
 
 
387 aa  110  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
470 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
459 aa  107  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
416 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
371 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
453 aa  106  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
371 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
418 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 
374 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
414 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  23.84 
 
 
416 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
416 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.45 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
371 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  29.96 
 
 
339 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.08 
 
 
403 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  27.35 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 
368 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.23 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
371 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 
416 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  27.35 
 
 
368 aa  97.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.04 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  27.3 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
421 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
384 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
390 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
402 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
378 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.09 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
372 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.09 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.09 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  27.09 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
372 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
372 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.58 
 
 
399 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  26.15 
 
 
372 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
370 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
383 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
372 aa  90.1  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
371 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
375 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.78 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.11 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.97 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 
402 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
421 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.78 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
373 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
421 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
424 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  27.25 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.06 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
375 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  22.09 
 
 
404 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
377 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>