More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1321 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
444 aa  905    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  33.48 
 
 
461 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
419 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
413 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
416 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.11 
 
 
428 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
418 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
441 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
412 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1560  urea ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  24.46 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  26.79 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  26.04 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.74 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.83 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.83 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  25.83 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.14 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.83 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.83 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.83 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.83 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  23.01 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.17 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.28 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.33 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4292  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  20.81 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  23.23 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.21 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  23.86 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  24.56 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  23.86 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.25 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6073  Extracellular ligand-binding receptor  21.29 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  23.6 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  22.95 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.44 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>