More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6648 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  96.34 
 
 
382 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
382 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  79.94 
 
 
384 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  79.28 
 
 
386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  65.56 
 
 
384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.6 
 
 
389 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  63.46 
 
 
387 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  37.15 
 
 
443 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  37.18 
 
 
438 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
423 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  36.07 
 
 
411 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  34.35 
 
 
440 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  34.84 
 
 
414 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1597  urea ABC transporter, urea binding protein  33.59 
 
 
414 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.948764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 
421 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1953  putative aliphatic amidase expression-regulating protein (amiC)  32.08 
 
 
410 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  35.12 
 
 
405 aa  185  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3020  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  31.28 
 
 
412 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  34.29 
 
 
463 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  33.69 
 
 
397 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  32.8 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2663  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  31.4 
 
 
412 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 
419 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.55 
 
 
414 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  32.94 
 
 
418 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0349  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
407 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1255  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic protein  31.32 
 
 
445 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3202  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  30.5 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.836908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.1 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08881  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  31.01 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4292  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  32.11 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2250  putative urea ABC transporter, urea binding protein  31.94 
 
 
431 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.582147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  32.03 
 
 
431 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  32.04 
 
 
422 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2975  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.78 
 
 
416 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 
420 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1775  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 
414 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
421 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
421 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3322  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  30.68 
 
 
415 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12992  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 
840 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.3 
 
 
420 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1252  amide-urea binding protein  30.89 
 
 
392 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0854371  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  31.39 
 
 
425 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
402 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  31.39 
 
 
425 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  32.61 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  30.62 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  30.62 
 
 
391 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.379667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2193  urea ABC transporter, urea binding protein  31.77 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  29.82 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  31.77 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0697  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.18 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951166  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0829  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  30.75 
 
 
425 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08861  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  30.75 
 
 
425 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 
427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.49 
 
 
421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  30.47 
 
 
412 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 
402 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3145  urea ABC transporter, urea binding protein  30.57 
 
 
422 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  31.25 
 
 
417 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0948  branched-chain amino acid ABC transporter, putative  29.35 
 
 
427 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2620  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  30.77 
 
 
432 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0558299  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  31.71 
 
 
420 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0993  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.89 
 
 
426 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2620  putative UreA short-chain amide  30.91 
 
 
428 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0882904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7583  ABC transporter substrate-binding protein  31.86 
 
 
393 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185627  normal  0.979023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
419 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0301  ABC branched chain amino acid transporter, substrate binding protein  30.89 
 
 
426 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1945  ABC branched chain amino acid transporter, substrate binding protein  30.89 
 
 
426 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00107842  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 
428 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4149  putative urea short-chain amide or branched-chain amino acid uptake ABC transporter  29.76 
 
 
434 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2041  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  31.45 
 
 
418 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  31.2 
 
 
419 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00881  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.73 
 
 
403 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  31.91 
 
 
405 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3638  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.59 
 
 
382 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13399  normal  0.0727576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  30.71 
 
 
422 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0986  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
418 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.82 
 
 
421 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1200  urea ABC transporter, urea binding protein  28.57 
 
 
413 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1360  urea ABC transporter, urea binding protein  28.57 
 
 
413 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  29.82 
 
 
425 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3587  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.18 
 
 
418 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  30 
 
 
423 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.19 
 
 
421 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1662  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  28.81 
 
 
428 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
424 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.95 
 
 
421 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.95 
 
 
421 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  29.95 
 
 
421 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3732  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
424 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5512  ABC transporter substrate-binding protein  28.53 
 
 
422 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115941  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4636  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.9 
 
 
424 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  30.43 
 
 
422 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1103  urea ABC transporter, urea binding protein  29.84 
 
 
433 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>