More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1190 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  90.21 
 
 
402 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1190  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
401 aa  817    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1298  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  57.3 
 
 
419 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1194  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  58.01 
 
 
405 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1790  Leu/Ile/Val-binding family protein  52.24 
 
 
417 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  50.76 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0709  Leu/Ile/Val-binding family protein  51.73 
 
 
406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  51.4 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  51.6 
 
 
401 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.6 
 
 
401 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  51.15 
 
 
401 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  52.99 
 
 
413 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  51.33 
 
 
401 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  49.48 
 
 
401 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  50.27 
 
 
412 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3421  ABC transporter substrate-binding protein  49.35 
 
 
406 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  50.4 
 
 
400 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  49.33 
 
 
413 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  50.78 
 
 
400 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6215  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  51.72 
 
 
403 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  49.87 
 
 
400 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3789  Leu/Ile/Val-binding family protein  48.87 
 
 
409 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.710609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  50.4 
 
 
400 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  50.4 
 
 
400 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  48.46 
 
 
403 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5530  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  49.34 
 
 
401 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5024  extracellular ligand-binding receptor  49.74 
 
 
400 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.151241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  47.31 
 
 
405 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3757  ABC transporter substrate-binding protein  47.28 
 
 
409 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
402 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  48.42 
 
 
395 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  52.35 
 
 
411 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  49.1 
 
 
399 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5117  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  51.47 
 
 
404 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4079  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  50.27 
 
 
405 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4670  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.27 
 
 
403 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6351  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  48.94 
 
 
403 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3229  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  51.27 
 
 
412 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1677  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  51.9 
 
 
404 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  50.26 
 
 
401 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3122  Extracellular ligand-binding receptor  47.37 
 
 
419 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3593  putative ABC transporter substrate binding protein  48.52 
 
 
403 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.636574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2526  ABC transporter substrate-binding protein  50.26 
 
 
411 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4022  extracellular ligand-binding receptor  49.61 
 
 
404 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339015  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1850  putative ABC transporter, substrate binding protein  47.09 
 
 
402 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2487  Extracellular ligand-binding receptor  47.21 
 
 
404 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1377  ABC transporter substrate-binding protein  47.47 
 
 
404 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3348  extracellular ligand-binding receptor  51.08 
 
 
403 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.164921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3877  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.75 
 
 
406 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188449  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  48.24 
 
 
399 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1473  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.48 
 
 
406 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267716  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1674  ABC transporter substrate-binding protein  47.26 
 
 
409 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1578  ABC transporter substrate-binding protein  47.57 
 
 
402 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  47.16 
 
 
397 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2256  extracellular ligand-binding receptor  47.67 
 
 
403 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.777349  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0329  putative ABC transport protein substrate-binding component  48.29 
 
 
405 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42175  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3023  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  52.85 
 
 
406 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  47.76 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5300  putative periplasmic substrate binding protein  47.23 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1936  extracellular ligand-binding receptor  50.13 
 
 
409 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0141282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1152  UreA/short-chain amide ABC transporter  48.95 
 
 
415 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  46.32 
 
 
405 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0008  Extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 
408 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0278078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4932  extracellular ligand-binding receptor  44.87 
 
 
409 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.85 
 
 
416 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339692  normal  0.603773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2137  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand biinding protein  50.27 
 
 
404 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1820  Extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6432  extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 
407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00470186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3891  extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 
406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  47.96 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1254  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  48.65 
 
 
427 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3503  putative ABC transporter, substrate binding protein  47.37 
 
 
408 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  47.7 
 
 
402 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3282  Extracellular ligand-binding receptor  48.66 
 
 
408 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1339  ABC transporter substrate binding protein  49.73 
 
 
412 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358784  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0969  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  48.91 
 
 
405 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2460  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  47.38 
 
 
407 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.04538  normal  0.187515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3849  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  47.51 
 
 
392 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375619  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2953  ABC transporter substrate-binding protein  47.37 
 
 
408 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3779  putative ABC transporter, substrate binding protein  47.06 
 
 
408 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1421  UreA/short-chain binding protein of ABC transporter  47.68 
 
 
403 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3615  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.56 
 
 
404 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.489489  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2999  putative urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.72 
 
 
408 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0873398  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0182  extracellular ligand-binding receptor  44.44 
 
 
413 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3303  amide-urea binding protein  46.25 
 
 
404 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2079  branched chain amino acid transport system substrate binding protein  45.83 
 
 
404 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5957  extracellular ligand-binding receptor  43.08 
 
 
409 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2450  urea/short-chain binding protein of ABC transporter  46.58 
 
 
408 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.045034  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  44.72 
 
 
402 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  49.06 
 
 
401 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3783  ABC transporter substrate-binding protein  44.59 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  49.06 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3520  extracellular ligand-binding receptor  48.13 
 
 
407 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363976  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4449  Extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 
416 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29774  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.32 
 
 
402 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0731  hypothetical protein  46.98 
 
 
405 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183807  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  43.15 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  43.15 
 
 
402 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0659  putative substrate-binding protein  47.51 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0554  ureA/short-chain amide ABC transporter  44.81 
 
 
402 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.930825  normal  0.0786148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>