More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3805 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 450 aa  924    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  45.15 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  37.97 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  38.5 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  38.5 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  37.97 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  38.24 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  37.97 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  37.97 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  37.97 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  37.7 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  37.7 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  37.7 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 		 394 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  36.7 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.15 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  39.02 
 
 		 393 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  35.83 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  35.56 
 
 		 399 aa  223  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  37.08 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  36.68 
 
 		 407 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  34.77 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  32.6 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 408 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2526  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859261  normal  0.847765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  27.85 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.61 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 		 392 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  29.89 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  26.43 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  28.9 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  26.63 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4077  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  22.77 
 
 		 390 aa  96.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.29 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 395 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 406 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  26.29 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.52 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  26.72 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1803  hypothetical protein  25.88 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1077  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 397 aa  90.9  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000554995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  23.68 
 
 		 406 aa  90.1  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1793  hypothetical protein  25.28 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  22.95 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2030  LivK, ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  24.22 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.438312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  24.33 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  23.37 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1607  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.78 
 
 		 392 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.6 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 386 aa  87  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4690  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 397 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2475  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  22.49 
 
 		 405 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2936  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  23.42 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3375  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.42 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>