More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3240 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  100 
 
 
405 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  72.41 
 
 
407 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  67.93 
 
 
419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  63.07 
 
 
418 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  66 
 
 
419 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  63.17 
 
 
421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  63.17 
 
 
421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  64.56 
 
 
402 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  66.13 
 
 
463 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  64.05 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  62.2 
 
 
421 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  59.84 
 
 
413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  54.87 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  55.5 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  54.95 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  52.86 
 
 
438 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  55.43 
 
 
405 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.38 
 
 
393 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  48.62 
 
 
393 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  47.45 
 
 
422 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  47.45 
 
 
422 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  47.45 
 
 
423 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.26 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  47.69 
 
 
421 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  47.38 
 
 
397 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3881  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  48.08 
 
 
411 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.47 
 
 
421 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  49.47 
 
 
421 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  47.2 
 
 
421 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.83 
 
 
421 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  44.88 
 
 
421 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  48.83 
 
 
421 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1988  putative substrate-binding periplasmic transport protein  47.12 
 
 
423 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1421  putative substrate-binding periplasmic transport protein  49.6 
 
 
422 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  46.1 
 
 
419 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2873  urea ABC transporter, urea binding protein  49.21 
 
 
422 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2794  urea ABC transporter, urea binding protein  49.21 
 
 
422 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1340  urea ABC transporter urea binding protein  49.21 
 
 
422 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.231626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  49.73 
 
 
420 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4885  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.7 
 
 
421 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4633  urea ABC transporter, urea binding protein  48.68 
 
 
421 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688874  normal  0.0837107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0986  twin-arginine translocation pathway signal  48.81 
 
 
418 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2250  putative urea ABC transporter, urea binding protein  48.43 
 
 
431 aa  361  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.582147  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2620  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  50.36 
 
 
432 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0558299  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  47.84 
 
 
431 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0697  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.68 
 
 
425 aa  359  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951166  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  47.38 
 
 
417 aa  358  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.21 
 
 
421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  48.94 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  48.41 
 
 
425 aa  356  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.95 
 
 
420 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  49.2 
 
 
428 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3145  urea ABC transporter, urea binding protein  50.82 
 
 
422 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  48.14 
 
 
427 aa  353  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3587  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.55 
 
 
418 aa  352  5e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.77 
 
 
424 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3732  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.77 
 
 
424 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4636  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.77 
 
 
424 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  47.61 
 
 
420 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5512  ABC transporter substrate-binding protein  46.56 
 
 
422 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115941  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3780  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  44.39 
 
 
404 aa  348  7e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.583472  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  48 
 
 
416 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.04 
 
 
421 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0220  urea ABC transporter, urea binding protein  47.39 
 
 
421 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  47.75 
 
 
422 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.46 
 
 
414 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  49.16 
 
 
425 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  45.24 
 
 
418 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  49.16 
 
 
425 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1255  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic protein  48.14 
 
 
445 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2193  urea ABC transporter, urea binding protein  45.52 
 
 
418 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0994  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.74 
 
 
454 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.603537  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1504  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  44.28 
 
 
435 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00196796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  46.3 
 
 
420 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00881  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  48.28 
 
 
403 aa  346  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1662  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  47.22 
 
 
428 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6186  urea ABC transporter, urea binding protein  48.63 
 
 
410 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411723  normal  0.830735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1019  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  45.99 
 
 
424 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0798  urea ABC transporter, urea binding protein  44.53 
 
 
435 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.398503  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3067  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.04 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3103  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.04 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3127  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.04 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0787  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.77 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2041  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  46.61 
 
 
418 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2565  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.8 
 
 
435 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000125255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2176  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein, putative  43.8 
 
 
435 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4014  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.28 
 
 
435 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0416471  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0732  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.8 
 
 
435 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2048  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.8 
 
 
435 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0410415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  45.74 
 
 
420 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0188  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.14 
 
 
444 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4184  ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  46.38 
 
 
430 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.11561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2482  urea ABC transporter, urea binding protein  44.04 
 
 
435 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0880  urea ABC transporter, urea binding protein  44.04 
 
 
435 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1139  urea ABC transporter, urea binding protein  48.63 
 
 
413 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0431  twin-arginine translocation pathway signal  44.04 
 
 
435 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0910  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  44.04 
 
 
435 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08881  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  49.47 
 
 
425 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2975  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.66 
 
 
416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  45.74 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.379667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>