More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2260 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  76.19 
 
 
438 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  100 
 
 
440 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  72.71 
 
 
423 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  74.94 
 
 
443 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2620  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  60.59 
 
 
432 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0558299  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  59.78 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2250  putative urea ABC transporter, urea binding protein  56.98 
 
 
431 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.582147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08881  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  61.5 
 
 
425 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  59.23 
 
 
425 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  59 
 
 
425 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  57.24 
 
 
419 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0829  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  61.75 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08861  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  61.5 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  55.53 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  57.76 
 
 
419 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  56.05 
 
 
407 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  57.91 
 
 
405 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  52.72 
 
 
421 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  52.48 
 
 
421 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  52.72 
 
 
421 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  54.1 
 
 
402 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  53.9 
 
 
463 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  53.33 
 
 
402 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  50.73 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3780  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  48.74 
 
 
404 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.583472  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  51.79 
 
 
840 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0798  urea ABC transporter, urea binding protein  48 
 
 
435 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.398503  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0880  urea ABC transporter, urea binding protein  48 
 
 
435 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1504  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  48 
 
 
435 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00196796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2482  urea ABC transporter, urea binding protein  48 
 
 
435 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0431  twin-arginine translocation pathway signal  48 
 
 
435 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0787  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.12 
 
 
435 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0910  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  48 
 
 
435 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  53.68 
 
 
393 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3881  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  52.13 
 
 
411 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  51.3 
 
 
422 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  48.24 
 
 
417 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2048  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0410415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.57 
 
 
393 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2176  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein, putative  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253407  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0986  twin-arginine translocation pathway signal  50.77 
 
 
418 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3127  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4014  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0416471  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3067  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0732  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2565  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000125255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  51.04 
 
 
422 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  51.02 
 
 
419 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3103  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.29 
 
 
435 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2193  urea ABC transporter, urea binding protein  50.26 
 
 
418 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  50.65 
 
 
423 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1255  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic protein  48 
 
 
445 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2041  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  50.52 
 
 
418 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  50.52 
 
 
418 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.26 
 
 
421 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  50.26 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.26 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  52.29 
 
 
405 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  50.39 
 
 
421 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  50.13 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2251  urea ABC transporter, urea binding protein  46.12 
 
 
433 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3683  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.84 
 
 
432 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  50.26 
 
 
421 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  51.15 
 
 
425 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0994  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 
454 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.603537  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0697  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.64 
 
 
425 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951166  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.75 
 
 
414 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4885  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50 
 
 
421 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  49.24 
 
 
420 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0954  urea ABC transporter, urea binding protein  46.56 
 
 
431 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  50.13 
 
 
421 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4633  urea ABC transporter, urea binding protein  49.74 
 
 
421 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688874  normal  0.0837107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1988  putative substrate-binding periplasmic transport protein  49.14 
 
 
423 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
419 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1421  putative substrate-binding periplasmic transport protein  49.74 
 
 
422 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1775  twin-arginine translocation pathway signal  49.51 
 
 
414 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  49.1 
 
 
422 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  51.1 
 
 
413 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  48.24 
 
 
421 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.48 
 
 
421 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1340  urea ABC transporter urea binding protein  49.09 
 
 
422 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.231626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2794  urea ABC transporter, urea binding protein  49.09 
 
 
422 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2873  urea ABC transporter, urea binding protein  49.09 
 
 
422 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4184  ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  49.87 
 
 
430 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.11561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0993  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  45.89 
 
 
426 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  48.83 
 
 
420 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  46.45 
 
 
427 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0188  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  46.87 
 
 
444 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0948  branched-chain amino acid ABC transporter, putative  47.16 
 
 
427 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1019  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  46.56 
 
 
424 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  51.91 
 
 
420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  48.28 
 
 
420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00881  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  46.98 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0301  ABC branched chain amino acid transporter, substrate binding protein  45.25 
 
 
426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1945  ABC branched chain amino acid transporter, substrate binding protein  45.25 
 
 
426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00107842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4149  putative urea short-chain amide or branched-chain amino acid uptake ABC transporter  47.76 
 
 
434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1202  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  47.52 
 
 
419 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  48.68 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  47.54 
 
 
420 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.65 
 
 
421 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>