More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3732 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3145  urea ABC transporter, urea binding protein  78.05 
 
 
422 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  99.53 
 
 
424 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  75.29 
 
 
420 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  81.41 
 
 
421 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0220  urea ABC transporter, urea binding protein  76.6 
 
 
421 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618006  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3587  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  76.87 
 
 
418 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3732  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
424 aa  882    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4636  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
424 aa  882    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.71 
 
 
414 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  71.12 
 
 
420 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5512  ABC transporter substrate-binding protein  69.98 
 
 
422 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115941  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3572  ABC transporter substrate-binding protein  71.56 
 
 
422 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  69.3 
 
 
420 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3381  ABC transporter substrate-binding protein  71.88 
 
 
417 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3690  urea ABC transporter, urea binding protein  71.88 
 
 
417 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0976  urea ABC transporter, urea binding protein  69.6 
 
 
426 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1775  twin-arginine translocation pathway signal  72.22 
 
 
414 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  71.54 
 
 
391 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.379667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1252  amide-urea binding protein  71.28 
 
 
392 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0854371  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0593  urea ABC transporter, urea binding protein  68.75 
 
 
418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  67.08 
 
 
421 aa  568  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6186  urea ABC transporter, urea binding protein  73.1 
 
 
410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411723  normal  0.830735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  67.81 
 
 
416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2975  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.49 
 
 
416 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1597  urea ABC transporter, urea binding protein  66.59 
 
 
414 aa  551  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.948764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1139  urea ABC transporter, urea binding protein  66.58 
 
 
413 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1360  urea ABC transporter, urea binding protein  65.83 
 
 
413 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1200  urea ABC transporter, urea binding protein  65.83 
 
 
413 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  59.67 
 
 
393 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  58.97 
 
 
393 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  57.75 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  50.12 
 
 
418 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  50.81 
 
 
419 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  50.36 
 
 
443 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  49.33 
 
 
423 aa  363  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  49.73 
 
 
440 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  47.91 
 
 
438 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  48.77 
 
 
405 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  47.43 
 
 
419 aa  349  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  49.45 
 
 
407 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  44 
 
 
402 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  46.43 
 
 
421 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  43.5 
 
 
402 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  49.08 
 
 
431 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2250  putative urea ABC transporter, urea binding protein  46.97 
 
 
431 aa  332  7.000000000000001e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.582147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  45.33 
 
 
421 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  45.33 
 
 
421 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  45.75 
 
 
463 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  44.5 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  45.11 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08881  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.91 
 
 
425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2620  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  43.96 
 
 
432 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0558299  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.66 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.66 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3881  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  41.92 
 
 
411 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  44.17 
 
 
840 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1662  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  41.8 
 
 
428 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08861  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.67 
 
 
425 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0829  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.67 
 
 
425 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  41.43 
 
 
417 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5281  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  38.27 
 
 
425 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3780  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  40.87 
 
 
404 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.583472  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  42.67 
 
 
422 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44 
 
 
421 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  42.4 
 
 
422 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  43.73 
 
 
421 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.73 
 
 
421 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.06 
 
 
421 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  42.82 
 
 
420 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4633  urea ABC transporter, urea binding protein  42.93 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688874  normal  0.0837107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  43.2 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1421  putative substrate-binding periplasmic transport protein  43.09 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  42.4 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1988  putative substrate-binding periplasmic transport protein  40.43 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  42.13 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  42.67 
 
 
421 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0994  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.6 
 
 
454 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.603537  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  42.67 
 
 
421 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2251  urea ABC transporter, urea binding protein  41.34 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4885  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.09 
 
 
421 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.67 
 
 
421 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0880  urea ABC transporter, urea binding protein  43.16 
 
 
435 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2482  urea ABC transporter, urea binding protein  42.9 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0431  twin-arginine translocation pathway signal  43.16 
 
 
435 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0910  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  43.16 
 
 
435 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2794  urea ABC transporter, urea binding protein  42.93 
 
 
422 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1340  urea ABC transporter urea binding protein  42.93 
 
 
422 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.231626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2873  urea ABC transporter, urea binding protein  42.93 
 
 
422 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4014  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.63 
 
 
435 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0416471  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4229  hypothetical protein  41.94 
 
 
426 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.527328  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  41 
 
 
418 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0798  urea ABC transporter, urea binding protein  42.36 
 
 
435 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.398503  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0787  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.36 
 
 
435 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  40.51 
 
 
427 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  41.49 
 
 
420 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0301  ABC branched chain amino acid transporter, substrate binding protein  38.54 
 
 
426 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1504  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  42.36 
 
 
435 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00196796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  40.69 
 
 
420 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  40.79 
 
 
419 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1945  ABC branched chain amino acid transporter, substrate binding protein  38.54 
 
 
426 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00107842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>