More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS1792 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  96.3 
 
 
405 aa  784    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  96.79 
 
 
405 aa  789    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  100 
 
 
405 aa  828    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  96.05 
 
 
405 aa  782    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  99.26 
 
 
405 aa  824    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  96.3 
 
 
405 aa  783    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  100 
 
 
395 aa  807    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  99.01 
 
 
405 aa  824    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  94.81 
 
 
405 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  96.79 
 
 
405 aa  787    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  46.17 
 
 
415 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
399 aa  362  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  48.52 
 
 
400 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 
394 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  48.53 
 
 
395 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  47.98 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  49.46 
 
 
400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  47.17 
 
 
397 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  48.12 
 
 
397 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  46.9 
 
 
393 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  47.98 
 
 
399 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  37.97 
 
 
450 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  34.06 
 
 
470 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  33.17 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
420 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 
384 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
393 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 
391 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 
390 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
395 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
415 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.36 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 
415 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.64 
 
 
415 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  25.64 
 
 
455 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.99 
 
 
390 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  30.53 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
395 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  28.93 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
389 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  28.57 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 
391 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 
412 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 
402 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
388 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
401 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2526  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  28.07 
 
 
471 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859261  normal  0.847765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
388 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
392 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
395 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
419 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
389 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  27 
 
 
406 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
408 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 
413 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
390 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
393 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 
381 aa  100  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 
391 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.2 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  26.92 
 
 
418 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 
437 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  26.9 
 
 
402 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.33 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  27.48 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.03 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  24.54 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 
441 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>