More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2551 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  81.82 
 
 		 397 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  90.03 
 
 		 399 aa  698    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 400 aa  816    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  80.49 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  73.37 
 
 		 415 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  81.28 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  76.41 
 
 		 403 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  70.7 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  69.15 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  70.16 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  70.16 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  69.62 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  46.19 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.68 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  46.68 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.68 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  46.87 
 
 		 395 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.68 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.44 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.68 
 
 		 405 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  46.19 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.19 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  36.13 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 		 470 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  33.25 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  30.83 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  25.78 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.53 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  24.68 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  28.69 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.91 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  26.26 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  27.97 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  26.51 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  25.63 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  26.53 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  21.27 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  25.06 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4215  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  25.78 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  24.61 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2526  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  24.93 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859261  normal  0.847765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0563  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  24.54 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  24.44 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>