More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0331 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  90.69 
 
 		 399 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 403 aa  825    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  76.41 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  75.95 
 
 		 399 aa  594  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  72.97 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  69.19 
 
 		 415 aa  574  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  70.93 
 
 		 397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  62.37 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  61.05 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  61.29 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  64.25 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  63.44 
 
 		 393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  46.08 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.84 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.84 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  46.58 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.58 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.33 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  46.33 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  46.33 
 
 		 395 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  46.33 
 
 		 405 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  46.58 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  35.31 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  31.97 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 420 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  27.57 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.37 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  28.08 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4215  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  26.18 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 395 aa  89.7  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0563  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  24.88 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  26.51 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  25.28 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  24.32 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.05 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>