123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2173 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  100 
 
 		 455 aa  917    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2526  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  49.64 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859261  normal  0.847765 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.34 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  26.34 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.11 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  25.87 
 
 		 405 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  25.64 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.41 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  25.64 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  25.41 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.96 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 400 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  24.82 
 
 		 399 aa  87  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  24.45 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  31.73 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  23.22 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.38 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.24 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  22.15 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4420  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.65 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  24.65 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  21.15 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  24.13 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  31.95 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  19.41 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  20.92 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  26.64 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3756  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  21.27 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  21.88 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  22.71 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  22.71 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  25.1 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  21.53 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  22.05 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  20.41 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  23.41 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0757  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.13 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  20.53 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  24 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1862  extracellular ligand-binding receptor  21.36 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485563  normal  0.350266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  23.96 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  20.96 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  20 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  29.7 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3887  ureA/short-chain amide ABC transporter  22.05 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 		 412 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  23.37 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  21.82 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1750  Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  22.48 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.175864  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  20.16 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4400  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  22.59 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  20.25 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  26.74 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2318  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  20.31 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  0.535279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>