More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0994 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 391 aa  799    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  48.98 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  46.85 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  45.91 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  47.53 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  45.57 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  44.85 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  45.71 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  48.9 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  43.48 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  41.26 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  41.69 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  44.38 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  41.78 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  46.83 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  48.35 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  42.62 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  42.28 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  41.88 
 
 		 389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  41.92 
 
 		 390 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  44.11 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  36.81 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  43.41 
 
 		 376 aa  289  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  36.81 
 
 		 393 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  34.08 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  34.38 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  32.91 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  33.83 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 		 390 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  33.63 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 410 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  31.09 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  32.33 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  28.82 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.57 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1110  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.48 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 391 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 		 392 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.5 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  26.56 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.38 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.24 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  28.31 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.87 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  23.34 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  25.14 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1283  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.96 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>