More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4395 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 395 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  57.07 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  46.87 
 
 		 379 aa  348  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  40.59 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  41.18 
 
 		 389 aa  312  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  44.29 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 389 aa  308  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  43.01 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  45.57 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 		 388 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  41.69 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  44.57 
 
 		 376 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  39.89 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  40.55 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  39.8 
 
 		 390 aa  272  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  38.3 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  38.66 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  38.07 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  37.21 
 
 		 395 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  37.73 
 
 		 389 aa  262  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  37.87 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  35.99 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  38.63 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  41.42 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  32.91 
 
 		 393 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  33.05 
 
 		 402 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  34.01 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  30.14 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  24.81 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.73 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.36 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  27.42 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.8 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  25.84 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  27.2 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.04 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.35 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  26.53 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0659  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.69 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  25.08 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  21.88 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1597  urea ABC transporter, urea binding protein  24.73 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.948764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.84 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>