More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5126 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 388 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  60.7 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  57.65 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  54.12 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  57.14 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  52.91 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  55.16 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  53.83 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  51.91 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  48.45 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  50.82 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  46.19 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  45.91 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  48.36 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  49.45 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  45.43 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  45.5 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  44.99 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  47.16 
 
 		 381 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  47.25 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  43.65 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  47.25 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  43.72 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  43.04 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  41.16 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  44.96 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  41.6 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  33.93 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  34.23 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  33.24 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  33.96 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  32.73 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  34.33 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  32.15 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 		 387 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31.93 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  31.83 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  32.96 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  31.49 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.58 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  29.06 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.91 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.65 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  27.48 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  27.64 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.6 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>