More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3830 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
390 aa  793    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  66.76 
 
 
391 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  65.21 
 
 
401 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  62.37 
 
 
395 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  58.6 
 
 
388 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  50.9 
 
 
388 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  53.97 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  48.47 
 
 
389 aa  363  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
390 aa  358  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  45.52 
 
 
389 aa  352  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  45.64 
 
 
389 aa  348  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  46.38 
 
 
389 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  48.91 
 
 
376 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  48.35 
 
 
379 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  44.01 
 
 
389 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  45.94 
 
 
381 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  40.71 
 
 
391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  42.49 
 
 
390 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  41.09 
 
 
390 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  43.01 
 
 
379 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  43.41 
 
 
396 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  42.86 
 
 
398 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  40.82 
 
 
407 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  39.07 
 
 
390 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  39.8 
 
 
395 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  41.32 
 
 
386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  45.33 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  41.58 
 
 
399 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  34.78 
 
 
393 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  33.86 
 
 
402 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  32.64 
 
 
387 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 
390 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
392 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  31.93 
 
 
389 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  32.01 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 
393 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
390 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
387 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
395 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 
397 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
395 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  29.7 
 
 
406 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
390 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 
395 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 
392 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 
410 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
397 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
414 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
392 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
426 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
390 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
423 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
412 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.81 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.56 
 
 
390 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 
390 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 
400 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 
392 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 
392 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
395 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.95 
 
 
399 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
401 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.22 
 
 
392 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  30.95 
 
 
392 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 
413 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  26.99 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
390 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  30.42 
 
 
393 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  28.3 
 
 
406 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  27.31 
 
 
368 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
392 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  25.25 
 
 
416 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
390 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
413 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
390 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  25.8 
 
 
397 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
415 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
415 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
415 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 
395 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 
391 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>