228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5186 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 425 aa  845    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  44.77 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  39.47 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  38.73 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 		 426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.02 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  33.58 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  30.15 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 390 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  28.42 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  29.04 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 		 401 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 388 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  27.88 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  25.33 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  26.68 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 395 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  24.21 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  24.21 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  26.98 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  25.55 
 
 		 396 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  25.2 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  25.2 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.68 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  27.84 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.02 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  24.12 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  25.7 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  22.02 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>