More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4140 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 370 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  75.89 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  72.97 
 
 		 370 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  73.51 
 
 		 370 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  72.43 
 
 		 368 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  74.72 
 
 		 373 aa  551  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  62.97 
 
 		 374 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  62.97 
 
 		 374 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  63.79 
 
 		 368 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  55.41 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  57.43 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  55.41 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  47.55 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  45.87 
 
 		 378 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  39.52 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  34.84 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  34.84 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  35.63 
 
 		 398 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  34.34 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  33.69 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 		 392 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  34.55 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  34.67 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  32.86 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  33.72 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.77 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  32.19 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  32.67 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  32.4 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  32.73 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  32.22 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  28.03 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 		 384 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.71 
 
 		 425 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  27.11 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 592 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.08 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.52 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.8 
 
 		 517 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  27.84 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  26.59 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3147  hypothetical protein  26.32 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  26.22 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  25.79 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.4 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>