More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0432 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
412 aa  830    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.39 
 
 
395 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  41.55 
 
 
411 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  44.24 
 
 
406 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  41.55 
 
 
411 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  42.4 
 
 
409 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  45.04 
 
 
406 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  41.94 
 
 
409 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  41.51 
 
 
409 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  43.7 
 
 
406 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  40.7 
 
 
410 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  43.09 
 
 
406 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  38.41 
 
 
407 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.05 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  39.51 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  39.37 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  41.49 
 
 
410 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  40.21 
 
 
411 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  42.67 
 
 
406 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  44.26 
 
 
437 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1842  hypothetical protein  39.95 
 
 
405 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  39.7 
 
 
407 aa  308  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  41.67 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  41.22 
 
 
435 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  41.42 
 
 
401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  38.24 
 
 
409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  40.97 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  41.71 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  39.89 
 
 
411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  40.85 
 
 
403 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  41.18 
 
 
410 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  40.94 
 
 
411 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  40.69 
 
 
405 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  39.89 
 
 
410 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  37.8 
 
 
404 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  39.8 
 
 
400 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  39.3 
 
 
407 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  40 
 
 
406 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  39.34 
 
 
406 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  38.15 
 
 
406 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0801  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  38.21 
 
 
409 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.0350726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3633  Extracellular ligand-binding receptor  37.83 
 
 
402 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  37.4 
 
 
402 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  36.53 
 
 
399 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4713  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  35.53 
 
 
414 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  38.01 
 
 
434 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  36.86 
 
 
441 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  36.55 
 
 
436 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  30.56 
 
 
480 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 
401 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.37 
 
 
425 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
472 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
398 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 
377 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
403 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
386 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
389 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 
386 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
392 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
394 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2700  hypothetical protein  29.23 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75707  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0555  hypothetical protein  27.81 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  24.85 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
423 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.17 
 
 
517 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
382 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
425 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2955  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  27.46 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0324512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
385 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.02 
 
 
519 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.34 
 
 
496 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  28.14 
 
 
539 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
384 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3366  hypothetical protein  28.72 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729663  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3216  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.32 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.844613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  28.92 
 
 
497 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3230  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.58 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  26.51 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0606  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  25.92 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6234  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  29.11 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>