More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1290 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
392 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.49 
 
 
399 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
376 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
398 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.65 
 
 
395 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
381 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
399 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1027  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
384 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000299575  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2263  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
369 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0102579  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
383 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.14 
 
 
396 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
390 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 
386 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
402 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  26.63 
 
 
392 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
410 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
390 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
419 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.21 
 
 
399 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.27 
 
 
391 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
397 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 
397 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.86 
 
 
404 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.25 
 
 
397 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 
385 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
370 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4482  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
407 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.5 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.15 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  26.91 
 
 
379 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
389 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
394 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
421 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
421 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.68 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
379 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.48 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1214  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
386 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
378 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.36 
 
 
376 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.48 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.48 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.97 
 
 
380 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
393 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
397 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>