More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 320 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.88 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.7 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  34.28 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  36.68 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  23.82 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.42 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  49.18 
 
 		 878 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3443  transcriptional regulator, LuxR family  23.17 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00126305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0985  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.880452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0209  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213353  normal  0.452607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  37.23 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 498 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25010  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.51 
 
 		 484 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0341  transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 478 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.953627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  36.17 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 213 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  56.25 
 
 		 213 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  52.38 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05591  DNA-binding response regulator  54.17 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 217 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 217 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  40 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.83 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1925  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00015523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  41.18 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 506 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10150  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.28 
 
 		 483 aa  50.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.906615  hitchhiker  0.00359447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.11 
 
 		 545 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1093  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.569375  hitchhiker  0.0000000000000377381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0440  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 526 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  47.92 
 
 		 917 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 965 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0289  transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 498 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.797409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  42.62 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  50 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2758  transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 		 523 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  57.14 
 
 		 877 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  42.86 
 
 		 91 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  48.89 
 
 		 535 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0368  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 516 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 492 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0349  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1682  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  52.08 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  42.86 
 
 		 90 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17090  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.5 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  28.03 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>