More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0349 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0349  response regulator receiver protein  100 
 
 		 392 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  39.51 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0348  putative GAF sensor protein  36.06 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  32.76 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 302 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  55.93 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1627  two component LuxR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0484719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  44.83 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.86 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  44.83 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 239 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  35.4 
 
 		 218 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  54.84 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 258 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 220 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 245 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 232 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  48.33 
 
 		 213 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  43.59 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  35.09 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4009  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  0.324745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.99 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 814 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.93 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 886 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  48.28 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  46.27 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  46.27 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  38.57 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  52.54 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  45.61 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>