79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  100 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  36.96 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  36.96 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  36.96 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  36.96 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  36.96 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  37.78 
 
 		 462 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  38.29 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  36.36 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  33.57 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  34.51 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  32.87 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  35.69 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  35.8 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  32.47 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  35.41 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  34.54 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  35.06 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  32.63 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  31.6 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  32.68 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  33.66 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  30.63 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.69 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  30.97 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  32.3 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  30.23 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.21 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  29.48 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  29.48 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  29.48 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  29.48 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  29.1 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  31.01 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  29.43 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  29.06 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 348 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  28.25 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  24.61 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  31.85 
 
 		 357 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  32.6 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  27.3 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  28.18 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  31.76 
 
 		 346 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  31.76 
 
 		 346 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  31.76 
 
 		 346 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  27.9 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  27.46 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  29.64 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  30.56 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  29.64 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  29.64 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  29.64 
 
 		 417 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  29.64 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  29.64 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  25.44 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  31.23 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  32.6 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.69 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  29.75 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  29.03 
 
 		 473 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  24.38 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  27.82 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  27.24 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  42.19 
 
 		 549 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  38.75 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>