83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2091 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 352 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  93.56 
 
 		 357 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  83.24 
 
 		 346 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  81.82 
 
 		 346 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  82.1 
 
 		 346 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  82.1 
 
 		 346 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  79.55 
 
 		 348 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  68.71 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  69.02 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  68.1 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  68.1 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  68.1 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  68.1 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  64.22 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  55.26 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  56.91 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  55.59 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  55.59 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  50.79 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  51.63 
 
 		 303 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  51.61 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  51.92 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  45.24 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  44.07 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  43.45 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  40.2 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.26 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  39.59 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  40.27 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  39.59 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  39.59 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  33.57 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.64 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  38.43 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  34.62 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  37.63 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  36.15 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  36.15 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  35.98 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  33.98 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.85 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  34.36 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.79 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  31.56 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.86 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  29.21 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  30.85 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  26.33 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  29.04 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  29.04 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  26.15 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  25.91 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  32.58 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  31.7 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  32.34 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  29.25 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  25.6 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.26 
 
 		 288 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  29.27 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.97 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  45.19 
 
 		 104 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  29.9 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  30.45 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  29.96 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.47 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  26.81 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  32.69 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  25.6 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>